申論 1請說明哈溫平衡（Hardy-Weinberg equilibrium）定律之內容。（4 分）假設F 族群中有8 個個體為純合子基因型BB，74 個個體為雜合子基因型Bb，18 個個體為純合子基因型bb，請以普氏方格（Punnett square）列出F 族群逢機配種後F 族群之基因與基因型頻率。（10 分）又動物育種可以那些方法突破哈溫平衡，增加我們需要之基因與基因型頻率？（6 分）
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弱點分析
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申論 2請說明動物經濟性狀的遺傳估測方法，選拔指數（selection index）法與最佳線性無偏估測（best linear unbiased prediction）法，其基礎理論的主要差異為何？（8分）並說明過去30年來以最佳線性無偏估測法所選拔之動物，藉由種公畜名錄（siresummary）出版，對於動物遺傳改進的影響。（12分）
申論 3請說明遺傳相關（genetic correlation）及引起遺傳相關的主要原因。（8 分）並闡述育種者利用相關性狀的間接選拔代替直接選拔的理由，舉例說明之。（12 分）
申論 4請說明育種者使用近親配種（inbreeding mating）的理由。（10 分）為何有相當大量的近親衰退與雜種優勢都與適應性狀（fitness traits）有關？（10 分）
申論 5生物科技在動物育種領域的應用可以分成生殖技術（項目包括人工授精、胚移置、性別控制、純系選殖）與分子生物技術（項目包括DNA 指紋、分子標記標識輔助選拔、基因轉殖）兩大類，請分別敘述這兩類技術所包含的項目及其對於動物育種工作之影響。（20 分）