申論 1微生物在環境中氮循環扮演極關鍵性的角色，請列舉說明氮循環中五種主要反應及參與各反應的代表菌屬（Genus），並舉例闡述都市生活污水中的氨氮如何去除？（40 分）
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弱點分析
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申論 2微生物的細胞結構、生化代謝以及生理生長功能相當複雜，請闡述控制微生物生長作用的機制，並舉例說明一種方法如何只抑制細菌（Bacteria），但不影響古菌（Archaea）的生長。（30 分）
申論 3請詳述大腸桿菌（Escherichia coli）的定義，並申論以培養法（例如濾膜法）分析大腸桿菌的結果應用於評估地面水體受糞便污染的優點與缺點。（20 分）
申論 4厭氧消化（Anaerobic Digestion）是一種處理有機廢棄物的方法，這個方法的原理是在密閉的反應槽中培養大量的厭氧微生物，將有機物轉化成無害的最終產物。以葡萄糖為例，請闡述葡萄糖如何在厭氧消化槽中被相關微生物轉化成最終產物。（10 分）