申論 1固氮菌與豆科植物建立共生關係進行固氮作用的過程中，如何轉換產生有機氮？PII 蛋白質如何調控此過程？固定的氮如何輸出到宿主其他部位？並請用簡圖說明類菌體（bacteroid）光合作用、呼吸作用與固氮作用之相互關係。（25 分）
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申論 2請說明臺灣常見的空氣污染物，二氧化硫、臭氧與霧霾對農作物生長之影響。（25 分）
申論 3請說明植物光合作用、呼吸作用與植物次級代謝物之關係。並說明次級代謝中5-烯醇丙酮莽草酸-3-磷酸鹽合成酶（5-enolpyruvyl-shikimate-3-phosphatesynthase; EPSPS）在植物生理上的重要性，舉例說明在農業生產上的應用。（25 分）
申論 4請說明葉綠體類囊體（thylakoid）膜中光合電子傳遞系統組成及如何將光能轉變成化學能。其與粒線體電子傳遞系統組成的差異為何？並比較循環與非循環光磷酸化作用之差異。（25 分）